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PROPOSTAS DE PROJECTOS

Contribution for the simultaneous PET/MRI imaging of the breast using a fully integrated PET/MRI breast coil

PET/MRI

IBEB

This project aims at obtaining an engineering solution for a simultaneous, non-conventional fully integrated PET/MRI breast imaging coil. In this solution, PET and MRI should be performed using the same physical support, a modified breast MRI coil. The project will require solid knowledge about MRI electromagnetics, coils and positron emission state-of-the art detection systems. Simulation packages both for PET and MRI will be used. A common-frame image reconstruction solution will be developed based on non-trivial data sampling on PET.

REQUISITOS

The project will require solid knowledge about MRI electromagnetics, coils and positron emission state-of-the art detection systems

DURAÇÃO DO PROJECTO

3-4 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Creating a deformable and mechanically realistic computer model of the female breast medical imaging data

MEDICAL IMAGING

IBEB e INESC-ID (IST – ULisboa)

This project aims at producing a deformable, mechanically realistic model of the female breast than would be useful for several types of medical simulation (imaging and the training of breast surgery for example). MRI breast imaging sets with anatomical and angiographic data will be used. This project will require solid knowledge on finite elements and image segmentation of medical images. The development of the project can be interfaced with INESC-ID (IST – ULisboa)

REQUISITOS

This project will require solid knowledge on finite elements and image segmentation of medical images

DURAÇÃO DO PROJECTO

3-4 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Developing the basic framework for PET image reconstruction using ultra-fast (ps) PET ToF imaging

PET

IBEB

This project aims at understanding the advantages and limitations of using ultra-fast (10 ps time-resolution) detection chains in PET for imaging. The framework to be developed will take into account the how dynamic PET imaging can be optimized for the study of the physiology of biological phenomena. This project requires solid mathematical background and good knowledge of radiopharmaceutical uptake and use in the human body.

REQUISITOS

This project requires solid mathematical background and good knowledge of radiopharmaceutical uptake and use in the human body

DURAÇÃO DO PROJECTO

3-4 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

A very fast, multiplexed cell-sorting system using SiPM and Ultra-Fast detectors

MEDICAL IMAGING

IBEB

This project aims at proposing a solution for a radically new cell sorter system to use in Biology/Genetics labs. This new system will use state-of-the art Silicon Photomultipliers and their detection spectral characteristics to obtain multi-thread cell imaging and sorting. This project will require good knowledge about sensors for biological applications and about cell physiology and imaging principles. This project may be developed in collaboration with the German company KTEK.

REQUISITOS

This project will require good knowledge about sensors for biological applications and about cell physiology and imaging principles

DURAÇÃO DO PROJECTO

3-4 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Study of the effects of Breast Chemotherapy Drugs on the brain

IMAGEM MÉDICA

IBEB e Fundação Champalimaud

This project builds on a financed project which will be running in collaboration with the Champalimaud Foundation. It will aim at characterizing and correlating the regional brain glucose consumption with biochemical markers of the use of chemotherapeutical drugs used for breast cancer treatment.

REQUISITOS

This project will require good knowledge about brain anatomy and physiology and about the general principles of breast cancer chemotherapy

DURAÇÃO DO PROJECTO

3-4 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Development of a new, low cost system for lung ventilation exams in nuclear medicine

IMAGEM MÉDICA

IBEB

This project aims at developing and testing a new system for improving the quality of scintigraphic lung exams in nuclear medicine by using positive pressure ventilation systems. This project will require the development of a computer model of the human airways able to provide information about the flow of DTPA-labeled molecules in different lung pathological conditions.
This project may be lead with the collaboration of the veterinary school for testing the solutions proposed in animal models before applying for human testing. This project will be developed with the collaboration of the Nuclear Medicine Department of Hospital de Santa Cruz in Carnaxide.

REQUISITOS

This project will require good knowledge about physiology and about computational models

DURAÇÃO DO PROJECTO

3-4 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Estudo do efeito de encadeamento luminoso em sinais de EEG de indivíduos a realizar tarefas que exijam concentração

Engenharia Biomédica (Neuroanálise)

LOLS (Campus do Lumiar) e IBEB

O objetivo desta tese de mestrado é o de aferir a capacidade de uma interface cérebro-computador em adquirir dados de Eletroencefalografia (EEG) em situações de encadeamento luminoso. A massificação do acesso a fontes de luz de elevada potência e direccionalidade (como sejam os apontadores laser, mas também algumas lanternas) tem levado a um acréscimo da preocupação com os potenciais efeitos da sua utilização. Mais do que os efeitos diretos de destruição de partes da retina (apesar de tudo, menos prováveis), o foco tem-se dirigido para os efeitos relacionados com a alteração de estados de concentração sobre indivíduos a executar tarefas cuja concentração é crítica (como pilotos de helicóptero ou condutores de viaturas pesadas). Este efeito é conhecido por “encadeamento” (ou, do inglês, dazzling) e é tipicamente um efeito deletério temporário sobre a capacidade de visão ou concentração. No entanto, enquanto os danos sobre a retina podem ser quantificados, os efeitos de encadeamento, sendo indiretos (com base na afetação da execução de uma determinada tarefa), são tipicamente qualitativos (ou, pelo menos, com uma quantificação mais subjetiva). Neste âmbito, a utilização de interfaces cérebro-computador capazes de analisar a resposta cerebral a estímulos externos, abre uma porta no sentido de criação de uma nova ferramenta para avaliar os efeitos de encadeamento. A prova de conceito deverá ser realizada utilizando o equipamento e a experiência no estudo do encadeamento existentes nos grupos envolvidos neste projeto.

REQUISITOS

Engenharia Biomédica ou Engenharia Física

Conhecimento razoável de óptica

DURAÇÃO DO PROJECTO

3 a 6 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A ser definido

CONTACTO

João Pinto Coelho

joao.coelho@fc.ul.pt

Hugo Ferreira

hhferreira@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Instrumentação para avaliação da fotoactivação de sistemas de entrega de fármacos ou hipertermia em meios biológicos turbidos utilizando radiação laser

Engenharia Biomédica (Terapia do cancro – instrumentação)

LOLS (Campus do Lumiar)

Os lasers têm sido muito utilizados em aplicações biomédicas: desde servir de ferramenta para técnicas de diagnóstico não intrusivas, a instrumento cirurgico. Apesar da muita pesquisa realizada nos últimos anos, e até da existência de muitos produtos comerciais utilizando a tecnologia a laser na área biomédica, o interesse no assunto ainda se encontra muito ativo. Em particular, o uso da radiação laser para activar nanopartículas na terapia tumoral, para entrega de fármacos ou ablação do tumor, tem sido objeto de muita investigação, de certa maneira seguindo os avanços no campo da nanotecnologia aplicada à medicina. Nestes campos, uma equipa da FCUL em colaboração com outras instituições tem vindo a participar no desenvolvimento de novas técnicas para a terapia de tumores utilizando radiação laser e nanopartículas. Uma das tarefas mais difíceis foi identificada como sendo o desenvolvimento e implementação de metodologias para avaliar a temperatura no interior de fantomas específicos sob irradiação laser. Neste caso, a medição deve ser o o menos intrusiva possível e insensível à própria radiação laser.
O trabalho a ser realizado consistirá em:
• Avaliação de possíveis técnicas de metrologia para medir o efeito térmico sobre um fantoma irradiado por laser. Será focada em particular a utilização de sensores de fibra óptica.
• Desenvolvimento de instrumentação necessária para implementar a técnica ou técnicas.
• Um fantasma ‘padrão’ será definido. As suas características devem reflectir as encontradas numa potencial aplicação real, mas também deve permitir a aplicação laboratorial de um ou mais sensores, a fim de monitorar a distribuição de temperatura em diferentes posições.
• Aplicação e teste de uma ou mais das técnicas consideradas em condições de irradiação.

REQUISITOS

Engenharia Biomédica ou Engenharia Física

Conhecimento razoável de óptica

DURAÇÃO DO PROJECTO

3 a 6 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A ser definido

CONTACTO

João Pinto Coelho

joao.coelho@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Study of minimum requirements for imaging the breast using Positron Emission Mammography

Engenharia Biomédica (Imagem Médica)

IBEB

This study aims at producing initial options for optimizing the number of detectors, scintillating material and sampling option in new state-of-the art PEM systems using Si-PM’s.

REQUISITOS

Estudante de Engenharia Biomédica com conhecimentos sólidos de tomografia por emissão de positrões e de ferramentas de simulação para imagem médica

DURAÇÃO DO PROJECTO

9 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A ser definido

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Feasibility study of an MRI breast coil incorporating PET detectors

Engenharia Biomédica (Imagem Médica)

IBEB

This study aims at producing initial options for understading how to optimize sampling options and electromagnetic shielding between a commercial MRI breast coil and an array of Si-PM detectors in order to obtain a “plug-and-play” solution to be used on an MRI system

REQUISITOS

Estudante de Engenharia Biomédica com conhecimentos sólidos de electromagnetismo e imagem por ressonância magnética

DURAÇÃO DO PROJECTO

9 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A ser definido

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

A study on the possibility of Multiplexed Cell sorting using SiPM technology

Engenharia Biomédica (Imagem Médica)

IBEB

This study aims at producing initial options for understanding the possibility of building a new system for cell sorting in biological applications using Si-PM’s and multiplexing data measurements

REQUISITOS

Estudante de Engenharia Biomédica com conhecimentos sólidos de fisiologia celular e óptica aplicada

DURAÇÃO DO PROJECTO

9 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A ser definido

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Creating a simplified deformable computer model for the female breast using MRI data

Engenharia Biomédica (Imagem Médica)

IBEB e INESC-ID (IST-ULisboa)

This study aims at producing a deformable breast model useful to include in breast imaging simulation and on augmented and virtual reality solutions useful for surgical training in medicine.
The project may be done in collaboration with INESC-ID (IST-ULisboa).

REQUISITOS

Estudante de Engenharia Biomédica com conhecimentos sólidos de modelos de elementos finitos e segmentação de imagem

DURAÇÃO DO PROJECTO

9 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A ser definido

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Processamento de imagem em tomossíntese

Digital Breast Tomosynthesis (DBT) is a new technique that has the ability to address mammography’s limitations because it takes a series of projection images from different source positions and combines them to reconstruct 3D image using approximately the same dose of two mammograms. Currently, handling noise level is a major problem in DBT images mainly due to low dose projections and incomplete sampling of the projection frequency space due to the limited angular range used.
Total Variation (TV) based minimization algorithms have achieved great success due to its virtue of preserving edges while reducing image noise. TV is a quantity that characterizes how smoothly the intensity of an image is changing and it increases significantly in the presence of noise. We developed a successful method based on TV minimization to reduce DBT images noise. One of the steps involves the discretization of the solution found by the Euler-Lagrange equation with Finite Difference Methods. The objective of this work is to evaluate different schemes for this gradient discretization and its impact on the filtered image.

REQUISITOS

PROCESSAMENTO DE IMAGEM

PROGRAMAÇÃO EM MATLAB

IMAGEM MÉDICA

DURAÇÃO DO PROJECTO

1-2 meses

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Ana Mota

ammota@fc.ul.pt

NunoMatela

nmatela@fc.ul.pt

APPLICATION FORM

Development of a training tool for breast surgeons: from virtual reality to the clinical setting

IMAGEM MÉDICA

IBEB

This project aims at producing/using a deformable, mechanically realistic model of the female breast to be used for surgical training. This model will be coupled to a virtual reality platform and haptic control in order to simulate the procedures applied when using mastectomy and, if possible, breast reconstruction. This project will require solid knowledge on finite elements and image segmentation of medical images and virtual reality platforms. The development of the project can be interfaced with INESC-ID (IST – ULisboa). A candidate with a Ph.D, in Biomedical Engineering or Computer Sciences with solid knowledge about image processing and programming is desired.

REQUISITOS

A candidate with a Ph.D, in Biomedical Engineering or Computer Sciences with solid knowledge about image processing and programming is desired

DURAÇÃO DO PROJECTO

3 anos

INÍCIO DO PROJECTO

A definir

CONTACTO

Pedro Almeida

palmeida@fc.ul.pt

APPLICATION FORM